Комплексное решение для HLA типирование
Полноразмерное решение для типирования HLA от компании Qitan Technology позволяет осуществлять полноразмерную амплификацию и подготовку библиотек для 11 генов, включая HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DPA1, HLA-DPB1, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRB1 и HLA-DRB3/4/5. В сочетании с собственной платформой нанопорового секвенирования Qitan Technology и программным обеспечением для визуализации и типирования возможно получение результатов HLA-типирования с высоким разрешением и высокой точностью. Start pack для HLA
Характеристики продукта
Полноразмерное секвенирование
- Один рид покрывает весь ген, обеспечивая точное определение гаплотипов и высокое разрешение типирования
- Длинные чтения секвенирования дают равномерное покрытие
Гибкость метода
- Возможность обработки 1–288 образцов на одной многоразовой ячейке
- Компактные, экономически эффективные секвенаторы для малых и средних лабораторий
Сверх-быстрое типирование
- ПЦР-реакция в одной пробирке для каждого образца и лигирование адаптеров занимает всего 10 минут
- Анализ одного образца занимает около 3 часов 40 минут; обработка 16 образцов на Qcell-384 — примерно один день
Точность типирования
- Интегрированное программное обеспечение для секвенирования и HLA-типирования.
- Высокое качество данных после обработки достигает Q40.
- Существенно снижает количество неоднозначностей по сравнению с NGS.
Полная схема работы
Start pack для HLA
Full-length Human Leukocyte Antigen (HLA) Amplification Kit
Ultra-fast library prep kit
Ultra-fast barcoding kit - 16
DNA Sequencing kit
Максимально можно запустить 32 образца . Ограничено пропускной способностью QCell-384
Максимально можно запустить 48 образцов. Ограничено количеством ПЦР-баркодов в наборе HLA
Full-length Human Leukocyte
Antigen (HLA) Amplification Kit
- Полноразмерная амплификация 11 генов HLA
- Реакция ПЦР проводится в одной пробирке.
- Сверхбыстрая подготовка библиотеки позволяет провести полный анализ за 4 часа.
- Гибкая схема секвенирования поддерживает обработку от 1 до 288 образцов на ячейку.
- Высокая точность и автоматическое типирование HLA после секвенирования.
Ultra-fast barcoding kit - 16
- Простой и быстрый процесс: одна реакция лигирования адаптера с баркодом на образец.
- Параллельная обработка: до 16 образцов одновременно (16 уникальных баркодов).
Ultra-fast library prep kit
- Экономичная эффективность: одна реакция лигирования адаптера для до 48 образцов.
- Масштабируемость: одновременная обработка до 48 образцов.
Представление данных
Полноразмерное покрытие, гибкость секвенирования и низкая стоимость
- Одноэтапная ПЦР-реакция для полноразмерной амплификации 11 генов HLA с высокой равномерностью.
- Низкопроизводительная система Qcell-384 (1–16 образцов) и среднепроизводительная система Qcell-6K (1–288 образцов) обеспечивают гибкое и экономически эффективное секвенирование с возможностью настройки времени прогона и использованием многоразовых проточных ячеек.
Высокое качество данных и ПО
- Собственный алгоритм повышает качество данных до уровня примерно Q40 после обработки.
- ПО с графическим интерфейсом автоматически типирует аллели HLA, надежно работает при мутациях и рекомбинации.
Высокая точность типирования
Альфа-тестирование: 186 образцов, 99,52 % совпадение с клиническим типированием, сокращение 891 неоднозначности по сравнению с NGS.
| Gene | Ambiguity No. of NGS | Ambiguity No. of Nanopore |
| A | 14 | 0 |
| B | 7 | 0 |
| C | 2 | 0 |
| DPA1 | 0 | 0 |
| DPB1 | 324 | 0 |
| DQA1 | 5 | 0 |
| DQB1 | 241 | 0 |
| DRB1 | 160 | 0 |
| DRB345 | 138 | 0 |
| Total | 891 | 0 |
В ходе бета-тестирования более 1 000 образцов достигнуто 99,93 % совпадение с NGS; 13 несоответствий: 5 по Nanopore, 8 по лимитам NGS
| Gene | Allele number | Consistentrate | Inconsistent | Consistency rate |
| A | 2022 | 2022 | 0 | 100.00% |
| B | 2022 | 2020 | 2 | 99.90% |
| C | 2022 | 2019 | 3 | 99.85% |
| DPA1 | 2022 | 2022 | 0 | 100.00% |
| DPB1 | 2022 | 2017 | 5 | 99.75% |
| DQA1 | 2022 | 2022 | 0 | 100.00% |
| DQB1 | 2022 | 2021 | 1 | 99.95% |
| DRB1 | 2022 | 2021 | 1 | 99.95% |
| DRB345 | 2022 | 2021 | 1 | 99.95% |
| Total | 18198 | 18185 | 13 | 99.93% |
Информация для заказа
| Наименование | Комплект | Кат. номер |
| Human Leukocyte Antigen(HLA) Genotyping Kit | 96 rnxs/kit | O-0040 |
| Ultra-Fast library prep kit | 6 rnxs/kit | O-0042 |
| Ultra-Fast Barcoding Library Prep Kit-16 | 6 sets/kit(16 barcodes/set) | O-0043 |
| DNA sequencing kit | 6 rnxs/kit | O-0050 |
| Flow Cell Wash Kit-6 | 6 rnxs/kit | O-0048 |
| Flow Cell Wash Kit-6 | 48 rnxs/kit | O-0049 |
| Flow Cell QCell-384 | 1 pic | O-0051 |
| Flow Cell QCell-6k | 1 pic | O-0052 |
| Nanopore sequencer QNome-3841 | 1 pic | O-0011 |
| Nanopore sequencer QNome-3841hex | 1 pic | O-0012 |
| Nanopore sequencer QPursue-6K | 1 pic | O-0021 |
| Nanopore sequencer QPursue-6khex | 1 pic | O-0022 |
| QPreasy-NF HLA Sequencing and Typing System | 1 unit | O-0016 |
